並非所有產自「已登記養魚場」的魚類都可用「優質養魚場」的品牌銷售。只有在養殖週期開始時已經登記，並在銷售前已通過所有品質保證測試的魚類才可用「優質養魚場」的品牌銷售。
魚苗登記制度可防止有人利用「魚酒店」來濫用這計劃。每種魚的魚苗數量和養殖週期都會詳細記錄和保存，因此，進口魚類或來自未經登記的養魚場的魚類都不能經由「已登記養魚場」以「優質養魚場」的品牌銷售。此外，魚苗登記制度可用來追查魚產品的來源，方便執行品質保證程序。
「已登記養魚場」必須在購入魚苗14天內通知漁護署進行檢查和魚苗登記，而該批已登記魚苗的養殖期不得少於180天，否則該批魚類日後不能以「優質養魚場」的品牌出售。
首次成功申請成為「已登記養魚場」的舊有魚類，可在登記後14天內補辦魚苗登記，而該批魚類的養殖期不得少於登記後180天，否則不能以「優質養魚場」的品牌出售。